Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
GscQ02591 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
GscQ02591 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
GscQ02591 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms