Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb2Q00977 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms