Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SeleQ00690 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms