Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms