Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AlkP97793 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AlkP97793 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AlkP97793 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms