Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Clec4f-201ENSMUST00000014686 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Arhgef10l-204ENSMUST00000105797 3507 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Msh4-203ENSMUST00000188338 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Dclre1b-201ENSMUST00000029435 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm21276-201ENSMUST00000179666 2626 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cited1P97769 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms