Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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SmsP97355 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SmsP97355 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SmsP97355 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SmsP97355 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SmsP97355 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SmsP97355 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SmsP97355 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SmsP97355 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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SmsP97355 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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SmsP97355 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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SmsP97355 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SmsP97355 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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SmsP97355 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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SmsP97355 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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SmsP97355 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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SmsP97355 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SmsP97355 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SmsP97355 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SmsP97355 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SmsP97355 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms