Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rps3aP97351 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms