Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms