Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RhodP97348 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms