Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Irx1P81068 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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Irx1P81068 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Irx1P81068 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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