Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ptprn2P80560 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptprn2P80560 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptprn2P80560 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptprn2P80560 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptprn2P80560 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ptprn2P80560 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.8 ms