Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Otx1P80205 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms