Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
UbdP63072 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
UbdP63072 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms