Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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