Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snap25P60879 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snap25P60879 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snap25P60879 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snap25P60879 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snap25P60879 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Snap25P60879 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snap25P60879 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snap25P60879 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snap25P60879 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snap25P60879 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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