Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CgnP59242 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CgnP59242 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CgnP59242 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CgnP59242 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CgnP59242 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CgnP59242 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CgnP59242 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CgnP59242 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CgnP59242 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms