Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn18P56857 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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