Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rrp1P56183 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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