Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PctpP53808 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PctpP53808 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms