Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Efnb1P52795 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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