Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms