Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
FmodP50608 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
FmodP50608 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
FmodP50608 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
FmodP50608 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
FmodP50608 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms