Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Srp9P49962 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms