Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gli1P47806 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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