Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms