Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ItgavP43406 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms