Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gdf5P43027 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf5P43027 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gdf5P43027 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms