Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf1P39428 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf1P39428 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf1P39428 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms