Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprkP35822 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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