Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc5P32043 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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