Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hoxc11P31313 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hoxc11P31313 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hoxc11P31313 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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