Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PtprmP28828 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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