Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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