Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Psmb9P28076 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Psmb9P28076 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Psmb9P28076 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Psmb9P28076 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Psmb9P28076 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Psmb9P28076 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Psmb9P28076 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Psmb9P28076 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Psmb9P28076 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms