Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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PdgfraP26618 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PdgfraP26618 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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