Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChgaP26339 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChgaP26339 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChgaP26339 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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