Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms