Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ggta1P23336 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ggta1P23336 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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