Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PparaP23204 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms