Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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PdgfaP20033 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PdgfaP20033 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PdgfaP20033 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PdgfaP20033 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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