Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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NelfeP19426 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NelfeP19426 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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