Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RhoP15409 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhoP15409 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhoP15409 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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