Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms