Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms