Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxd4P10628 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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