Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms