Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms