Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Kcns1O35173 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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