Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20878L7N244 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20878L7N244 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20878L7N244 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20878L7N244 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20878L7N244 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gm20878L7N244 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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